打吹山の山頂（本丸）から西側へ20間（約36メートル）下がった位置に所在する。

主郭に対する防衛拠点として南条備前守が築いた二ノ丸（出丸）と伝え、当城が「備前丸」と呼称されるのは南条備前守が居住したことに因むとしており、南条備前守は南条元信としている。（伯耆民談記）

登山道脇の案内板から西側の尾根に向かうと比較的広い郭が見られ、伯耆民談記では南北14間（約26メートル）、東西19間（約35メートル）の規模としている。

本丸との間には二重堀切で隔絶された痕跡も見えるが、登山道の整備或いは大東亜戦争末期の「ち号演習」による塹壕掘削のために改変を受けている可能性が高い。

1562年（永禄5年）

毛利氏の支援を受けた南条宗勝が南条家の家城であった伯耆国羽衣石城を尼子氏から奪還すると続けて旧領であった久米郡内の所領も回復しており、伯耆国打吹城には南条元信、山田越中守など重臣が城番として置かれている。

この頃の本丸は打吹山の山頂ではなく、南条元信によって築かれた当出丸や山田越中守が置かれた打吹城越中丸などが推定される。

1579年（天正7年）

南条氏は織田氏へと与し毛利氏とは袂を別っている。

本城の打吹城には吉川元春からの検使として二宮木工助、城番として羽根兵庫助元安（伯耆民談記では兵庫頭）、牛尾大炊助、北谷刑部少輔が在番しており、南条氏の主要拠点であった羽衣石城や伯耆国岩倉城に対して毛利方は伯耆国今倉城に向城を築くなど包囲網を敷いている。

1580年1月9日（天正7年12月23日）

南条方の南条元続、南条元清が3,000騎を率いて打吹城へと攻め寄せたが吉川方の反撃により撃退されている。（陰徳太平記 巻六十一 伯州羽衣石山向城 付 宇津吹城合戦之事）

この戦では南条元信の嫡男、南条元周が300騎を率いて伯耆国田後城より援軍に向かっていたが間に合わず羽衣石城へと撤退している。

伯耆民談記ではこの時の南条元信の官途を「備前守」と記しているが、「南条信正他十四名連署起請文」では1575年（天正3年）までに南条信正へと「備前守」の官途が譲られていることがわかる。（伯耆民談記 巻之第十 河村郡古城之部 羽衣石城の事）

1584年（天正12年）

毛利氏と羽柴氏の和睦の後、中国国分により在地領主の所領が確定し打吹城は南条氏の領有となる。

1585年（天正13年）

伯耆国八橋城の城主であった南条元信は倉吉へと移り、打吹城内に居住とされる。

伯耆民談記 巻之第十五 久米郡古城之部 一、同城（倉吉）地理の項

伯耆民談記では南条元続が領主であった頃、南条元信が倉吉へと移り当城へ居住したことを城名の由来としていることから、1585年（天正13年）までには当城が存在していたこととなる。

当城の遺構には石垣が見られないことから、1591年（天正19年）に築城が始まる打吹城小鴨丸よりも古い施設と推定される。

因伯記要 第三章 名所旧跡 第五 東伯郡の条 倉吉城跡の項

因伯記要では打吹城の第二の城として格を上げた表現で取り扱われている。